分两种情况。 

根据我国法律规定，国有土地上的房屋征收，是由市、县级人民政府作出征收决定的。集体土地的征收，需省级人民政府或国务院批准，由市、县级人民政府予以公告并组织实施。这类的征收项目，村委会是没有权利和资格实施征收拆迁行为的，也是不能跟被征收人签署征收补偿协议。 

如果是村民自治腾退项目，集体土地性质没有发生变化，这类的项目一般村委会是实施主体，村委会有权跟村民签署补偿协议。